湘潭市发展和改革委员会内设12个科室,分别是:办公室、综合科、法规科(加挂湘潭市人民政府招标投标领导小组办公室)、改革科(加挂湘潭市经济体制改革领导小组办公室)、投资科(加挂湘潭市重大建设项目前期工作协调办公室)、商务科、农村经济科、工业交通能源科(加挂湘潭市国民经济动员办公室)、高技术产业科、社会发展科、组织干部科、离退休人员管理服务科。
其他机构3个,分别是:机关党委、监察室、市重大项目稽察特派员办公室。
二级机构5个,分别是:市区域经济协作办公室(加挂市长株潭经济一体化办公室)、市第三产业办公室、市重点工程管理办公室、市经济建设投资公司、湘潭工程咨询公司。